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依據地表水水域環境功能和保護目標，按功能高低依次劃分為五類：
Ⅰ類主要適用于源頭水、*家自然保護區；
Ⅱ類主要適用于集中式生活飲用水地表水源地一級保護區、*水生生物棲息地、魚蝦類產場、仔稚幼魚的索餌場等；
Ⅲ類主要適用于集中式生活飲用水地表水源地二級保護區、魚蝦類越冬場、洄游通道、水產養殖區等漁業水域及游泳區；
Ⅳ類主要適用于一般工業用水區及人體非直接接觸的*樂用水區；
Ⅴ類主要適用于農業用水區及一般景觀要求水域。
對應地表水上述五類水域功能，將地表水環境質量標準基本項目標準值分為五類，不同功能類別分別執行相應類別的標準值。水域功能類別高的標準值嚴于水域功能類別低的標準值。同一水域兼有多類使用功能的，執行*高功能類別對應的標準值。
